排泄孔位置及形状可分辨出雌雄：公佛罗里达箱龟的位置接近尾端，孔形长形。母佛罗里达箱龟的位置接近腹甲，孔形圆形。
还可以看尾部的粗细大小，公佛罗里达箱龟尾较粗大，母佛罗里达箱龟较细短。另外也可以看腹甲是否凹陷，公佛罗里达箱龟有明显的凹陷，母佛罗里达箱龟平坦。
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